根据二氧化氯发生器的二次供水系统特点，消毒剂投加点可选择在地下蓄水池或高位水箱两种方式。投加在地下蓄水池消毒剂与水能充分混合，同时保证高位水箱的水质；直接投加在高位水箱时投药量较少，但地下蓄水池长期不消毒也会滋生菌类和藻类，需定期消毒清洗。综合考虑到消毒设备在楼顶操作不便等原因，将投加点选在地下蓄水池较好。
由于二次供水系统一般无专人看管，启动关闭频繁，安全要求高，原材料消耗量少，故应选用投料精确的计量泵供料方式，可选用纯二氧化氯发生器系列或壁挂式二氧化氯发生器系列。
