次氯酸钠发生器的主要结构包括水软化装置、溶盐装置、电解装置、控制装置、储药装置和加药装置。其中，水软化装置负责将水质软化到适合电解的硬度，并减少主电解槽中的水垢输出。盐溶解装置负责将软化水与盐混合以产生低浓度盐水。电解装置负责将配制好的低浓度盐水电解成次氯酸钠消毒剂。控制装置、储药装置和加药装置是保证设备正常运行的重要部件。
当设备启动时，动力水将通过水管流入水软化装置，水软化装置中的水质硬度将降低。达到理想的电解水硬度后，在盐水溶解装置中用食用盐溶解，制得低浓度盐水。这些制备的低浓度盐水将通过管道输送到电解槽，次氯酸钠消毒剂将在电解槽中电解生产。次氯酸钠发生器采用无隔膜电解法，制造成本低，药品生产效率高，维护简便。电解装置制备的次氯酸钠消毒剂由投药装置投入指定的投药点。
在设备电解过程中电解槽发生的反应原理如下：
阳极反应：2C1<sup>-</sup>-2e→C1<sub>2</sub>↑
阴极反应：2Na<sup>+</sup>+2H<sub>2</sub>O+2e→H<sub>2</sub>↑+2NaOH
溶液反应：Cl<sub>2</sub>+2NaOH→NaCl+NaClO+H<sub>2</sub>O
总反应：NaCl+H<sub>2</sub>O→NaClO+H<sub>2</sub>↑
